Die Werkausgabe von Emanuel Hirsch ist auf 49 Bände angelegt, welche sukzessive erscheinen. Sie wurde von Hans-Martin Müller (†) begründet und wird derzeit von einem Herausgeberkreis unter der Leitung von Prof. Dr. Arnulf v. Scheliha weitergeführt.

In der Werkausgabe werden die wissenschaftlichen Veröffentlichungen Hirschs mit bisher unveröffentlichten Stücken aus dem Nachlaß vereint vorgelegt und zur selbständigen Weiterarbeit erschlossen. Die Bände können über den Buchhandel oder über den Verlag Hartmut Spenner erworben werden.

Die Ausgabe gliedert sich in:

Bd. 1-13 Historische Theologie

Bd. 14-27 Systematische Theologie und Philosophie

Bd. 28-33 Altes und Neues Testament

Bd. 34-35 Geschichtsphilosophie und Kirchenpolitik

Bd. 36-44 Praktische Theologie

Bd. 45-49 Textsammlungen

Bereits erschienene Bände

Bd.1. Lutherstudien 1. Hg. von H.M.Müller. 1998. 232 S., Kt. (Neubuch EUR 18,80) ISBN 978-3-927718-28-9

Bd.2. Lutherstudien 2. Hg. von H.M.Müller. 1998. 272 S., Kt. (Neubuch EUR 18,80) ISBN 978-3-927718-29-6

Bd.3. Lutherstudien 3. Aufsätze und zwei unveröffentlichte Vorträge aus den Jahren 1918-1954. Ausgewählt und hg. von H.M.Müller. 1999. 331 S., Kt. (Neubuch EUR 22,80) ISBN 978-3-927718-49-4

Bd.4. Die Theologie des Andreas Osiander und ihre geschichtlichen Voraussetzungen. Mit einer Einführung von G.Seebass hg. von A.Beutel. 2003. 337 S., Kt. (Neubuch EUR 22,80) ISBN 978-3-933688-90-3

Bd.5-9. Geschichte der neuern evangelischen Theologie 1-5. Hg. von Albrecht Beutel. 2000. 2.600 S., Kt. (Neubuch EUR 98,00) ISBN 978-3-933688-32-3

Bd. 11+12. Kierkegaard-Studien Bd.1+2. Neu gesetzt mit Zählung der Originalausgabe. Neu herausgegeben von H.M.Müller. 2006. 434/510 S., Kt. (Neubuch EUR 69,80) ISBN 978-3-89991-045-2

Bd. 13. Kierkegaard-Studien Bd.3. Aufsätze und Vorträge 1926 bis 1967. Hg. und eingel. von Hans Martin Müller. 2006. IV/339 S., Kt. (Neubuch EUR 29,80) ISBN 978-3-89991-062-9

Bd. 14. Dogmatische Einzelabhandlungen I, "Jesus Christus der Herr" und andere Beiträge zur Christologie. Hg. von Arnulf von Scheliha. 2010. 228 S., Kt. (Neubuch EUR 19,80) ISBN 978-3-89991-110-7

Bd.15/1. Dogmatische Einzelabhandlungen II: "Der Sinn des Gebets" und andere Beiträge zur Frömmigkeitstheorie. 2013. 173 S., Kt. (Neubuch 19,80 EUR) ISBN 978-3-89991-146-6

Bd. 17. Leitfaden zur christlichen Lehre Kritische Neuausgabe, hg. von Arnulf von Scheliha und Justus Bernhard, 2019, (Hardcover), 337 Seiten, ISBN-10 3-89991-205-5

Bd. 18/1 Christliche Rechenschaft I "Erläuterungen" zum "Leitfaden zur christlichen Lehre" Emanuel Hirsch und  Justus Bernhard, hg von Arnulf von Scheliha, 2020, Paperback, 606 Seiten, ISBN-10 3-89991-218-7

Bd. 18/2. Christliche Rechenschaft II "Ergänzungen" zum "Leitfaden der christlichen Lehre", hg. von Arnulf von Scheliha und Justus Bernhard, 2020, Paperback, 123 Seiten, ISBN-10 3-89991-219-7

Bd. 19. Das Wesen des Christentums. Neu hg. u. eingeleitet von Arnulf von Scheliha. 2004. XXXVIII/188 S., Kt. (Neubuch EUR 19,80) ISBN 78-3-89991-005-6

Bd. 20. Das Wesen des reformatorischen Christentums. Hg. von Arnulf v. Scheliha. 2000. IV/270 S., Kt. (Neubuch EUR 19,80) ISBN 978-3-933688-39-2

Bd. 21. Ethos und Evangelium. Hg. und eingeleitet von Friedrich Hauschildt. 2018. XL/IX/443 S., Kt. (Neubuch 32,80 EUR) ISBN 978-3-89991-199-2

Bd. 22. Weltbewußtsein und Glaubensgeheimnis. Hg. von Justus Bernhard und Arnulf von Scheliha. 2016. XI/160 S., Kt. (Neubuch 19,80 EUR) ISBN 978-3-89991-175-6

Bd. 24. Fichte-Studien. 1914-1929. Neu hg. und mit einem Nachwort versehen von Ulrich Barth. 2008. VI/451 S., Kt. (Neubuch EUR 32,80) ISBN 978-3-89991-083-4

Bd. 26. Hauptfragen christlicher Religionsphilosophie, hg von Dietz Lange, 2019, (Paperback) 411 Seiten, ISBN-10 3-89991-212-8

Bd. 31. Osterglaube. Die Auferstehungsgeschichten und der christliche Glaube. Mit anderen Arbeiten Emanuel Hirschs neu hg. von Hans Martin Müller. 2006. 222 S., Kt. (Neubuch EUR 19,80) ISBN 978-3-89991-063-6

Bd. 32. Das Alte Testament und die Predigt des Evangeliums. Mit anderen Arbeiten Hirschs neu hg. von H. M. Müller. 2006. 179 S., Kt. (Neubuch EUR 16,80) ISBN 978-3-89991-064-3

Bd. 36. Ihr aber seid Christi. Schopfheimer Predigten 1917. Hg. u. bearb. von H.M.Müller. 2001. VI/260 S., Kt. (Neubuch EUR 19,80) ISBN 978-3-933688-60-6

Bd. 37. Der Wille des Herrn. Predigten 1914-1925. Hg. und bearb. von H.M.Müller. 2001. 153 S., Kt. (Neubuch EUR 16,80) ISBN 978-3-933688-47-7

Bd. 38. Das Evangelium. Predigten (19261929). Hg. und bearb. von H.M.Müller. 2001. 161 S., Kt. (Neubuch EUR 16,80) ISBN 978-3-933688-48-4

Bd. 39. Das Wagnis des Glaubens. Predigten und Andachten (1930-1964). Neu bearb. und hg. von H.M.Müller. 2004. XI/328 S., Kt. (Neubuch EUR 22,80) ISBN 978-3-933688-99-6

Bd. 40. Zwiesprache auf dem Wege zu Gott. Ein stilles Buch. Hg. und bearb. von H. M. Müller. 2009. 328 S., Kt. (Neubuch EUR 22,80) ISBN 978-3-89991-089-6

Bd. 41 Predigerfibel. Hg., eingeleitet und mit Registern versehen von Andreas Kubik. 2013. zus. 472 S., Kt. (Neubuch 32,80 EUR) ISBN 978-3-89991-145-9

Bd. 42. Betrachtungen zu Wort und Gschichte Jesu, hg von Andreas Kubik, 2019, Softcover, 277 Seiten, ISBN-10 3-89991-207-1

Bd. 43. Praktische Theologie. Kleine Schriften zur Religionspädagogik, Homiletik, Liturgik und Literaturtheorie, hg. von Andreas Kubik. 2023. XXVIII 288 S., (Paperback 29,80) ISBN-10 3-89991-257-8

Bd. 44. Autobiographische Materialien. Aufsätze und unveröffentlichte Texte aus dem Nachlass, hg. von Friedrich Hauschildt. 2022. XXX, 281 Seiten,

ISBN: 9783899912548